Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCAP28676 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCAP28676 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCAP28676 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCAP28676 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GCAP28676 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GCAP28676 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCAP28676 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCAP28676 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCAP28676 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCAP28676 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCAP28676 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCAP28676 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCAP28676 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GCAP28676 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCAP28676 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCAP28676 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCAP28676 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCAP28676 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GCAP28676 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCAP28676 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCAP28676 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCAP28676 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GCAP28676 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCAP28676 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCAP28676 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCAP28676 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCAP28676 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCAP28676 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCAP28676 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCAP28676 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCAP28676 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCAP28676 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCAP28676 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCAP28676 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCAP28676 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCAP28676 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCAP28676 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCAP28676 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCAP28676 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCAP28676 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCAP28676 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCAP28676 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCAP28676 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GCAP28676 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GCAP28676 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCAP28676 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCAP28676 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCAP28676 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCAP28676 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCAP28676 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCAP28676 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCAP28676 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCAP28676 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCAP28676 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCAP28676 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCAP28676 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCAP28676 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GCAP28676 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCAP28676 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCAP28676 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCAP28676 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GCAP28676 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCAP28676 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCAP28676 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCAP28676 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCAP28676 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCAP28676 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCAP28676 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCAP28676 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCAP28676 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCAP28676 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCAP28676 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCAP28676 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCAP28676 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCAP28676 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCAP28676 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCAP28676 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCAP28676 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCAP28676 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCAP28676 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCAP28676 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCAP28676 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GCAP28676 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCAP28676 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCAP28676 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GCAP28676 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCAP28676 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCAP28676 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCAP28676 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCAP28676 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCAP28676 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCAP28676 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCAP28676 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCAP28676 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCAP28676 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCAP28676 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCAP28676 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCAP28676 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCAP28676 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms