Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SSFA2P28290 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSFA2P28290 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSFA2P28290 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms