Protein–RNA interactions for Protein: P24468

NR2F2, COUP transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F2P24468 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NR2F2P24468 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2F2P24468 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms