Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFNA1P20827 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA1P20827 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms