Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RXRAP19793 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RXRAP19793 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RXRAP19793 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RXRAP19793 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RXRAP19793 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RXRAP19793 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RXRAP19793 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RXRAP19793 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RXRAP19793 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RXRAP19793 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RXRAP19793 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RXRAP19793 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RXRAP19793 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RXRAP19793 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RXRAP19793 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RXRAP19793 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RXRAP19793 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RXRAP19793 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RXRAP19793 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RXRAP19793 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RXRAP19793 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RXRAP19793 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RXRAP19793 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RXRAP19793 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RXRAP19793 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RXRAP19793 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RXRAP19793 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RXRAP19793 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RXRAP19793 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RXRAP19793 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RXRAP19793 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RXRAP19793 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RXRAP19793 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RXRAP19793 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RXRAP19793 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RXRAP19793 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RXRAP19793 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RXRAP19793 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RXRAP19793 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RXRAP19793 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RXRAP19793 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RXRAP19793 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RXRAP19793 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RXRAP19793 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RXRAP19793 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RXRAP19793 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RXRAP19793 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RXRAP19793 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RXRAP19793 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RXRAP19793 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RXRAP19793 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RXRAP19793 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RXRAP19793 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RXRAP19793 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RXRAP19793 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RXRAP19793 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RXRAP19793 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RXRAP19793 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RXRAP19793 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RXRAP19793 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RXRAP19793 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RXRAP19793 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RXRAP19793 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RXRAP19793 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RXRAP19793 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RXRAP19793 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RXRAP19793 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RXRAP19793 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RXRAP19793 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RXRAP19793 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RXRAP19793 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RXRAP19793 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RXRAP19793 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RXRAP19793 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RXRAP19793 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RXRAP19793 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RXRAP19793 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RXRAP19793 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RXRAP19793 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RXRAP19793 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RXRAP19793 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RXRAP19793 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RXRAP19793 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RXRAP19793 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RXRAP19793 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RXRAP19793 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RXRAP19793 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RXRAP19793 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RXRAP19793 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RXRAP19793 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RXRAP19793 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RXRAP19793 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RXRAP19793 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RXRAP19793 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RXRAP19793 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RXRAP19793 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RXRAP19793 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RXRAP19793 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RXRAP19793 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms