Protein–RNA interactions for Protein: P08123

COL1A2, Collagen alpha-2(I) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL1A2P08123 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL1A2P08123 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL1A2P08123 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.6
COL1A2P08123 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL1A2P08123 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL1A2P08123 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms