Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40AO75400 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40AO75400 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40AO75400 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40AO75400 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF40AO75400 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40AO75400 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40AO75400 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40AO75400 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40AO75400 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40AO75400 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40AO75400 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40AO75400 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40AO75400 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40AO75400 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40AO75400 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRPF40AO75400 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PRPF40AO75400 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40AO75400 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40AO75400 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms