Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLIN3O60664 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLIN3O60664 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms