Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC7A4O43246 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms