Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAD1O00515 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAD1O00515 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAD1O00515 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAD1O00515 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAD1O00515 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAD1O00515 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAD1O00515 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAD1O00515 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAD1O00515 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LAD1O00515 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAD1O00515 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAD1O00515 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAD1O00515 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAD1O00515 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAD1O00515 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LAD1O00515 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAD1O00515 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAD1O00515 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAD1O00515 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAD1O00515 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAD1O00515 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAD1O00515 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAD1O00515 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAD1O00515 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAD1O00515 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAD1O00515 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAD1O00515 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAD1O00515 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAD1O00515 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAD1O00515 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAD1O00515 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAD1O00515 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LAD1O00515 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LAD1O00515 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LAD1O00515 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LAD1O00515 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAD1O00515 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAD1O00515 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
LAD1O00515 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LAD1O00515 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAD1O00515 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAD1O00515 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAD1O00515 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAD1O00515 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAD1O00515 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAD1O00515 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAD1O00515 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAD1O00515 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAD1O00515 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAD1O00515 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAD1O00515 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAD1O00515 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAD1O00515 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAD1O00515 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAD1O00515 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAD1O00515 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAD1O00515 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAD1O00515 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LAD1O00515 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAD1O00515 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAD1O00515 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAD1O00515 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAD1O00515 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LAD1O00515 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAD1O00515 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAD1O00515 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAD1O00515 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAD1O00515 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAD1O00515 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAD1O00515 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAD1O00515 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAD1O00515 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAD1O00515 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAD1O00515 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAD1O00515 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAD1O00515 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAD1O00515 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAD1O00515 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAD1O00515 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAD1O00515 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAD1O00515 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAD1O00515 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAD1O00515 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAD1O00515 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAD1O00515 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAD1O00515 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAD1O00515 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAD1O00515 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAD1O00515 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAD1O00515 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAD1O00515 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAD1O00515 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAD1O00515 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAD1O00515 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
LAD1O00515 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAD1O00515 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAD1O00515 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAD1O00515 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAD1O00515 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms