Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DFFAO00273 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DFFAO00273 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DFFAO00273 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DFFAO00273 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DFFAO00273 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DFFAO00273 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DFFAO00273 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
DFFAO00273 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DFFAO00273 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DFFAO00273 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DFFAO00273 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DFFAO00273 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DFFAO00273 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DFFAO00273 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DFFAO00273 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DFFAO00273 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DFFAO00273 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DFFAO00273 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DFFAO00273 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DFFAO00273 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DFFAO00273 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DFFAO00273 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DFFAO00273 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DFFAO00273 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DFFAO00273 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DFFAO00273 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DFFAO00273 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DFFAO00273 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DFFAO00273 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DFFAO00273 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DFFAO00273 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DFFAO00273 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DFFAO00273 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DFFAO00273 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DFFAO00273 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DFFAO00273 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DFFAO00273 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DFFAO00273 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DFFAO00273 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DFFAO00273 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DFFAO00273 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DFFAO00273 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DFFAO00273 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DFFAO00273 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DFFAO00273 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DFFAO00273 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DFFAO00273 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DFFAO00273 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DFFAO00273 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DFFAO00273 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DFFAO00273 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DFFAO00273 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DFFAO00273 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DFFAO00273 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DFFAO00273 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DFFAO00273 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DFFAO00273 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DFFAO00273 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DFFAO00273 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DFFAO00273 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DFFAO00273 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DFFAO00273 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DFFAO00273 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DFFAO00273 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DFFAO00273 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DFFAO00273 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DFFAO00273 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DFFAO00273 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DFFAO00273 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DFFAO00273 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DFFAO00273 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DFFAO00273 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DFFAO00273 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DFFAO00273 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DFFAO00273 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DFFAO00273 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DFFAO00273 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DFFAO00273 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DFFAO00273 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DFFAO00273 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DFFAO00273 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DFFAO00273 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DFFAO00273 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DFFAO00273 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DFFAO00273 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DFFAO00273 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DFFAO00273 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DFFAO00273 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DFFAO00273 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DFFAO00273 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DFFAO00273 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DFFAO00273 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DFFAO00273 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DFFAO00273 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DFFAO00273 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DFFAO00273 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DFFAO00273 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DFFAO00273 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DFFAO00273 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms