Protein–RNA interactions for Protein: B5ME19

EIF3CL, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CLB5ME19 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3CLB5ME19 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3CLB5ME19 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms