Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO3A2RU48 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO3A2RU48 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms