Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SETD1BQ9UPS6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SETD1BQ9UPS6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SETD1BQ9UPS6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SETD1BQ9UPS6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SETD1BQ9UPS6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SETD1BQ9UPS6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SETD1BQ9UPS6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
SETD1BQ9UPS6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SETD1BQ9UPS6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SETD1BQ9UPS6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SETD1BQ9UPS6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SETD1BQ9UPS6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SETD1BQ9UPS6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms