Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHA12Q9UN75 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCDHA12Q9UN75 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHA12Q9UN75 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms