Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
KDM5BQ9UGL1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KDM5BQ9UGL1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC35.79■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
KDM5BQ9UGL1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms