Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL9Q9P2J3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL9Q9P2J3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms