Protein–RNA interactions for Protein: Q9P107

GMIP, GEM-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMIPQ9P107 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GMIPQ9P107 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GMIPQ9P107 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GMIPQ9P107 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMIPQ9P107 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms