Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms