Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CDK12Q9NYV4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK12Q9NYV4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CDK12Q9NYV4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CDK12Q9NYV4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms