Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY87

SPANXC, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXCQ9NY87 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPANXCQ9NY87 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXCQ9NY87 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms