Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM161AQ9NX61 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM161AQ9NX61 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM161AQ9NX61 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM161AQ9NX61 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM161AQ9NX61 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM161AQ9NX61 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM161AQ9NX61 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM161AQ9NX61 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM161AQ9NX61 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM161AQ9NX61 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM161AQ9NX61 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM161AQ9NX61 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms