Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH2

ISYNA1, Inositol-3-phosphate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISYNA1Q9NPH2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ISYNA1Q9NPH2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISYNA1Q9NPH2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms