Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX2Q9NPC8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIX2Q9NPC8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX2Q9NPC8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms