Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GFRA4Q9GZZ7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA4Q9GZZ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms