Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHCBP1LQ9BZQ2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms