Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED9Q9BVK6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED9Q9BVK6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms