Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM56Q9BRZ2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM56Q9BRZ2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms