Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS25Q9BRG1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VPS25Q9BRG1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms