Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CITED2Q99967 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms