Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUFY1Q96T51 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY1Q96T51 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms