Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNBD2Q96M20 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNBD2Q96M20 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNBD2Q96M20 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms