Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXPE3Q969Y0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPE3Q969Y0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms