Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRIPQ8WXE1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRIPQ8WXE1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms