Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX31Q8N9S9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms