Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTD1Q8N815 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTD1Q8N815 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTD1Q8N815 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms