Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2R2Q712K3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2R2Q712K3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms