Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ70

SPDYA, Speedy protein A, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYAQ5MJ70 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPDYAQ5MJ70 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPDYAQ5MJ70 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPDYAQ5MJ70 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPDYAQ5MJ70 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPDYAQ5MJ70 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDYAQ5MJ70 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms