Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL39P5Q59GN2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms