Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAN3Q58A45 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAN3Q58A45 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAN3Q58A45 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAN3Q58A45 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAN3Q58A45 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PAN3Q58A45 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PAN3Q58A45 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PAN3Q58A45 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PAN3Q58A45 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PAN3Q58A45 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAN3Q58A45 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms