Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPEL1Q2QD12 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPEL1Q2QD12 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms