Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A9Q2M3M2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A9Q2M3M2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC5A9Q2M3M2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC5A9Q2M3M2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC5A9Q2M3M2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC5A9Q2M3M2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms