Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTF1Q16619 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTF1Q16619 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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