Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC37.45■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
EEA1Q15075 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.44■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
EEA1Q15075 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC37.37■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.57
EEA1Q15075 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
EEA1Q15075 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
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