Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SREBF2Q12772 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SREBF2Q12772 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
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