Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFF3Q07654 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFF3Q07654 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFF3Q07654 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFF3Q07654 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFF3Q07654 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFF3Q07654 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFF3Q07654 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFF3Q07654 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFF3Q07654 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFF3Q07654 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFF3Q07654 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TFF3Q07654 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms