Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3AQ05086 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.8 ms