Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GTF2IP78347 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GTF2IP78347 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2IP78347 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2IP78347 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2IP78347 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2IP78347 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF2IP78347 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF2IP78347 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF2IP78347 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF2IP78347 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GTF2IP78347 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF2IP78347 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GTF2IP78347 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2IP78347 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2IP78347 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2IP78347 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2IP78347 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2IP78347 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2IP78347 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF2IP78347 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF2IP78347 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GTF2IP78347 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF2IP78347 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GTF2IP78347 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GTF2IP78347 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
GTF2IP78347 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF2IP78347 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2IP78347 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2IP78347 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2IP78347 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GTF2IP78347 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2IP78347 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2IP78347 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTF2IP78347 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTF2IP78347 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTF2IP78347 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GTF2IP78347 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GTF2IP78347 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GTF2IP78347 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTF2IP78347 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GTF2IP78347 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF2IP78347 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms