Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVS71-1P61550 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVS71-1P61550 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms