Protein–RNA interactions for Protein: P55347

PKNOX1, Homeobox protein PKNOX1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX1P55347 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKNOX1P55347 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKNOX1P55347 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms